Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms