Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSBP1Q04837 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms