Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms