Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms