Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms