Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms