Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM3AP98173 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms