Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HBBP68871 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms