Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms