Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UFM1P61960 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UFM1P61960 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UFM1P61960 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms