Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPCS3P61009 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPCS3P61009 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPCS3P61009 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPCS3P61009 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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