Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms