Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms