Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DAP3P51398 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DAP3P51398 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms