Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB28P51157 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB28P51157 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB28P51157 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB28P51157 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB28P51157 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB28P51157 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB28P51157 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB28P51157 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB28P51157 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB28P51157 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB28P51157 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms