Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PXNP49023 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PXNP49023 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PXNP49023 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms