Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCLMP48507 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCLMP48507 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCLMP48507 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms