Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC19A1P41440 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms