Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms