Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORAP35398 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORAP35398 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORAP35398 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORAP35398 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORAP35398 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RORAP35398 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RORAP35398 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RORAP35398 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms