Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHBP21912 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHBP21912 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHBP21912 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHBP21912 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms