Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJA1P17302 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA1P17302 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA1P17302 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA1P17302 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA1P17302 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms