Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBL4AP11441 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBL4AP11441 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBL4AP11441 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBL4AP11441 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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UBL4AP11441 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UBL4AP11441 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UBL4AP11441 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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