Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms