Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
KRTAP1-4P0C5Y4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms