Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1AO95602 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1AO95602 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms