Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPBO95292 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPBO95292 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPBO95292 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VAPBO95292 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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VAPBO95292 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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