Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms