Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPLO60437 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPLO60437 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPLO60437 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPLO60437 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPLO60437 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms