Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SMIM1B2RUZ4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms