Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms