Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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