Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED16Q9Y2X0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms