Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms