Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRPF3Q9ULD4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms