Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms