Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPASTQ9UBP0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms