Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms