Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms