Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
POLR2J2Q9GZM3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms