Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms