Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDM5DQ9BY66 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms