Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCAPERQ9BY12 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms