Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTKNQ9BST9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms