Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNL2Q96S94 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms