Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SHDQ96IW2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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