Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN23Q96B33 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms