Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKD1Q969G9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NKD1Q969G9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms