Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMARCE1Q969G3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMARCE1Q969G3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms