Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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GTF3C6Q969F1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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